九寨溝海拔約3000米，屬高原濕潤氣候，山頂終年積雪。春天氣溫較低且變化較大，平均氣溫多在9℃至18℃之間，4月前有凍土及殘雪。夏天氣溫回升較快且穩定，平均氣溫在19℃至22℃，夜晚較涼，宜備薄毛衣。秋季天高氣爽、氣候宜人，氣溫多在7℃至18℃，晝夜溫差較大，特別是10月後的深秋，白天可穿兩件衣服甚至單衣，到了夜晚就得穿毛衣甚至防寒服了，10月下旬即有凍土出現；冬季較寒冷，氣溫多在0℃以下。九寨溝降雨少而集中(年降雨量不足600mm)，7、8月是典型的雨季。 去九寨溝旅遊以春末至秋初為宜，九月底至十月最佳。
九寨溝平均氣候一覽：
一月 2.5℃
二月 -1.0℃
三月 3.9℃
四月 9℃
五月 11.8℃
六月 14.3℃
七月 17℃
八月 16.4℃
九月 12.4℃
十月 8.3℃
十一月 2.3℃
十二月 -2.7℃

年平均氣溫 7.8℃ 歷史極端最高氣溫 32.6℃